Avis de soutenance - doctorat - Camille VIZON

Informations pratiques
Ecole doctorale 472
52, Avenue Paul Alduy Université de Perpignan Bâtiment U 66860 Perpignan cedex
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Soutenue par Camille VIZON

Importance des médiateurs chimiques et microbiens dans la structuration du recrutement corallien

Ces dernières décennies, les écosystèmes coralliens se sont rapidement dégradés à cause d'une augmentation des perturbations environnementales, conduisant à un déclin de leur couverture corallienne. Le recrutement corallien est un processus crucial permettant le renouvellement des populations. Les algues rouges calcifiées encroûtantes (CCA) servent de substrats d'accrochage pour de nombreuses espèces d'invertébrés marins, dont les larves de coraux. Cependant aucun stimulus chimique ou microbien n'a clairement été identifié. À l'inverse, les macroalgues et les cyanobactéries peuvent altérer le recrutement corallien via des composés allélopathiques présents dans la colonne d'eau, mais peu de ces composés ont été identifiés et leur importance écologique reste pour l'heure inconnue. Cette thèse a pour objectif d'identifier les médiateurs chimiques et microbiens structurant le recrutement corallien. Elle démontre que les exsudats des macroalgues et des cyanobactéries induisent un comportement de stress chez les larves de coraux. Ces exsudats sont enrichis en métabolites secondaires et stimulent la croissances de bactéries opportunistes et potentiellement pathogènes. Les métabolites de cyanobactéries (i.e., laxaphycines) réduisent la survie et inhibent le recrutement corallien à des concentrations proches de celles retrouvées autour des patches de cyanobactéries in situ. A l'inverse, les exsudats de CCA induisent un comportement de pré-implantation chez les larves de coraux. Ils sont enrichis en métabolites liés au métabolisme primaire (i.e., glycérophospholipides) et stimulent la croissance de bactéries bénéfiques. À l'aide d'extraits chimiques, cette thèse a permis de mettre en évidence des métabolites (i.e., glycérolipides, polysaccharides) produits par les CCA pouvant avoir un effet positif sur le recrutement corallien. Enfin, les larves étant capables de choisir leur substrat, ces recherches ont pu déterminer si l'habitat proche ensemence le microbiome des recrues au cours de leur développement. La présence de différentes algues n'a pas impacté le microbiome des recrues, et les algues n'ont pas agi comme réservoir bactérien. En combinant techniques de pointe en métabolomique, métabarcoding et écologie chimique, cette thèse aide à mieux comprendre la structuration et le fonctionnement des récifs coralliens, les mécanismes d'interactions entre organismes, et le rôle des bactéries et des biomolécules dans le milieu marin.

Chemical and microbial mediators as key structuring elements for coralrecruitment

Over the past few decades, coral reef ecosystems have undergone a rapid degradation, with increasing disturbances causing a decline in coral cover worldwide. Coral recruitment is a crucial process for the renewal of coral populations. Crustose coralline algae (CCA) serve as settlement substrate for many marine invertebrate larvae, including coral larvae. However, no specific chemical and microbial cues have been clearly identified. Inversely, macroalgae and benthic cyanobacteria can deter coral larval settlement via water-borne compounds, but few of these compounds have been investigated and their ecological relevance remains unclear. This thesis aimed to identify the chemical and microbial mediators influencing coral recruitment. It demonstrated that macroalgal and cyanobacterial exudates induce a stress behavior in coral larvae. These exudates were enriched in secondary metabolites and stimulated the growth of opportunistic and potentially pathogenic bacteria. Cyanobacterial metabolites (i.e., laxaphycins) reduced the survival and inhibited the settlement of coral larvae at concentrations found near cyanobacterial mats in situ. Conversely, CCA exudates induced a pre-settlement larval behavior. They were enriched in metabolites related to primary metabolism (i.e., glycerophospholipids) and stimulated the growth of beneficial bacteria. Using chemical extracts, this thesis identified several metabolites (i.e., glycerolipids, polysaccharides) produced by the CCA that may positively influence coral larval settlement. Finally, as larvae can choose their settlement habitat, this research addressed whether the nearby environment influences the early development of the coral microbiome. The presence of different algae did not impact the coral recruit microbiome, and the algal species did not act as a bacterial reservoir. By combining cutting-edge techniques in metabolomics, metabarcoding and chemical ecology, this thesis contributes to a better understanding of the structuring and functioning of coral reefs, the interaction mechanisms between organisms, and the role of bacteria and biomolecules in the marine environment.
Directeur de thèse :
Maggy NUGUES
Unité de recherche :
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Membres du jury :
  • Directeur de thèse : Maggy NUGUES
  • Rapporteur : Catherine LEBLANC , Directeur de recherche (Sorbonne Université)
  • Rapporteur : Peter SCHUPP , Professor (Carl von Ossietzky Universität Oldenburg)
  • Président : Medhi ADJEROUD , Directeur de recherche (Insititut de Recherche et de Développement (IRD))
  • Examinateur : Claudia POGOREUTZ , Chaire De Professeur Junior (Université de Perpignan)
  • Examinateur : Guillermo DIAZ-PULIDO , Professor (Griffith University)
Diplôme :
Doctorat Systèmes intégrés, environnement et biodiversité
Spécialité de soutenance :
Océanologie biologique et environnement marin