Microscope

Microscopie et analyse d'image : logiciels gratuits et outils IA

Formation certifiante
Formations professionnelles courtes
Certificat
Sciences, technologie, santé
Outils et méthodes communes
Mireille
ROSSEL
Sciences de la Vie et de la Terre

Cette formation s'adresse à tous ceux qui ont besoin de se former aux nouvelles techniques de microscopie et d’IA appliquées à l’analyse d’image.

Objectifs généraux de la formation

  • Donner les bases en microscopie et les applications en fonction des échantillons utilisés
  • Donner les bases d’analyse d’images avec les logiciels gratuits et ouverts jusqu’à l’automatisation avec les macros
  • Comprendre les mécanismes de base du Deep Learning et utiliser des outils reposant sur l’IA pour segmenter et classer des éléments d’intérêt

 

Objectifs détaillés de la formation décrits en compétences

  • Permettre à l’apprenant de planifier ses expériences en fonctions des microscopes à disposition et de leur performance (Module 1)
  • Permettre à l’apprenant de travailler les images acquises, de réaliser une analyse quantitative et qualitative (Module 1)
  • Analyser une image de microscopie et quantifier par les approches classique certains marquages (Module 2)
  • Automatiser l’analyse d’un grand nombre d’images (Module 2)
  • Analyser et quantifier de très grandes images issues d’un scanner de lame via QuPath (Module 3)
  • Utiliser des outils de Deep Learning pour certaines quantification complexes (Module 3)