Avis de soutenance - doctorat - Thomas GUTTIEREZ

Cette thèse porte sur Atrina vexillum (Born, 1778), un grand bivalve marin sessile appartenant à la famille des Pinnidae, encore peu étudié en Polynésie française. L'espèce est potentiellement importante sur le plan écologique, en tant que constructeur d'habitat, mais sa répartition, son écologie et sa biologie restent largement méconnues dans cette région. Dans ce contexte, un échantillonnage d'envergure a été réalisé sur six îles de l'archipel de la Société (Tahiti, Moorea, Huahine, Raiatea, Taha'a et Bora-Bora), pour un total de 2 650 individus collectés. La thèse s'articule autour de deux volets complémentaires : un volet écologique, visant à décrire l'habitat et la distribution de l'espèce, et un volet génétique, centré sur la diversité, la structuration et la parenté des populations. Le volet écologique a permis de combler un manque de données de base sur l'espèce. Des plongées systématiques ont permis de caractériser les habitats occupés (type de substrat, profondeur, environnement lagonaire ou de passe), les tailles des individus et les densités locales. L'analyse révèle une forte hétérogénéité spatiale, tant en termes de répartition que d'abondance. Certaines îles abritent des populations denses et localisées, tandis que d'autres présentent des individus très dispersés. La distribution semble influencée par la nature du substrat (préférence pour les zones meubles), la profondeur, et des facteurs environnementaux locaux. Ces résultats suggèrent une fragmentation importante des habitats favorables à A. vexillum, posant la question de la connectivité entre sites. Le volet génétique s'appuie sur le développement de 30 marqueurs microsatellites spécifiques à Atrina vexillum. Ces marqueurs ont été appliqués à deux échelles d'analyse. À l'échelle régionale, une analyse de structure génétique a été menée sur un large échantillon couvrant les six îles. Les résultats mettent en évidence une différenciation génétique significative entre les îles, malgré leur relative proximité géographique (quelques dizaines de kilomètres). Cette structuration suggère une connectivité restreinte, probablement limitée par les barrières naturelles que constituent les lagons, les passes récifales, les courants côtiers, mais aussi par les traits de cycle de vie de l'espèce, notamment un développement larvaire vraisemblablement restreint à l'échelle intra-lagonaire. À une échelle plus fine, une seconde série d'analyses a été menée spécifiquement à Bora-Bora, sur 1 205 individus génotypés. En utilisant des méthodes de reconstruction de parenté, il a été possible d'identifier de nombreux groupes familiaux, certains comprenant jusqu'à 19 individus apparentés (pleins ou demi-frères/sœurs). Ces résultats traduisent des épisodes de recrutement familial localisé, et confirment une dispersion larvaire probablement limitée dans le temps et dans l'espace. La cooccurrence fréquente d'individus apparentés sur un même site souligne l'importance des dynamiques de cohorte et de la reproduction localisée, avec des implications directes sur le renouvellement des populations. L'ensemble des résultats met en lumière une diversité génétique globalement élevée, une structuration inter-îles forte, et une structuration intra-île influencée par les relations de parenté. Ces observations remettent en question l'idée d'une dispersion larvaire pélagique large, souvent supposée chez les bivalves tropicaux, et soulignent au contraire la nécessité d'adopter une approche populationnelle à fine échelle pour la conservation. Ce travail propose ainsi des bases concrètes pour le suivi et la gestion locale de l'espèce dans les lagons polynésiens, en intégrant les spécificités écologiques, démographiques et génétiques propres à ces environnements insulaires. Il contribue plus largement à la compréhension des mécanismes de structuration des populations marines tropicales et de leur vulnérabilité face aux changements environnementaux et aux pressions anthropiques.