Thierry
WIRTH
En combinant modélisation, outils Bayésiens et génomique des populations, Thierry Wirth caractérise les processus évolutifs et sélectifs qui sont responsables de la structuration des populations microbiennes, ainsi que de l’émergence de résistances aux antibiotiques. Ses travaux se déclinent sur plusieurs micro-organismes cibles (Escherichia coli, Helicobacter pylori, Staphylococcus aureus et Mycobacterium tuberculosis) et s’inscrivent dans le cadre de collaborations nationales et internationales.
Il a notamment contribué à révéler l’origine et la propagation de la peste à échelle planétaire par des approches NGS. Il est aussi à l’origine de travaux pionniers qui ont permis de démontrer un lien entre le sexe et la virulence chez Escherichia coli, proposant ainsi un nouveau paradigme du passage de souches avirulentes vers des souches pathogènes.
Actuellement, il se consacre à la reconstruction de l’histoire évolutive du bacille de Koch, qui demeure la principale source de mortalité (d'origine infectieuse) chez l’espèce humaine. A échelle macrogéographique, ses travaux permettent d’appréhender le rôle des migrations contemporaines dans la propagation de souches multirésistantes (MDR), alors qu’à échelle plus fine ils permettent des suivis épidémiologiques, ainsi que l’identification des sources potentielles d’épidémies en cours.
Depuis Septembre 2022, Thierry Wirth est détenteur d'une Chaire Leibniz au Leibniz Science Campus of Evolutionary Biology Medicine of the Lung (EvoLung) à Borstel, en Allemagne.
https://www.leibniz-gemeinschaft.de/en/ueber-uns/international/leibniz-chairs
Publications majeures:
1. Merker M, Rasigade JP, Barbier M, Cox H, Feuerriegel S, Kohl TA, Shitikov E, Klaos K, Gaudin C, Antoine R, Diel R, Borrell S, Gagneux S, Nikolayevskyy V, Andres S, Crudu V, Supply P, Niemann S, Wirth T (2022). Transcontinental spread and evolution of Mycobacterium tuberculosis W148 European/Russian clade toward extensively drug resistant tuberculosis. Nature Communications, 15: 5105. IF = 17,70.
2. Wirth T (2021). When specialized clones go global. Nature Microbiology, 6: 1215-1216. IF = 30,96.
4. Wirth T (2015). Massive lineage replacements and cryptic outbreaks of Salmonella Typhi in Eastern and South Africa. Nature Genetics, 47: 565-567. IF = 41,31.
5. Merker M, Blin C, Mona S, Duforet-Frebourg N, Lecher S, Willery E, Blum M, Rüsch-Gerdes S, Mokrousov I, Aleksic E, Allix-Béguec C, Antierens A, Augustynowicz-Kopeć E, Ballif M, Barletta F, Beck HP, Barry III CE, Bonnet M, Borroni E, Campos-Herrero I, Cirillo D, Cox H, Crowe S, Crudu V, Diel R, Drobniewski F, Fauville-Dufaux M, Gagneux S, Ghebremichael S, Hanekom M, Hoffner S, Jiao WW, Kalon S, Kohl TA, Kontsevaya I, Lillebæk T, Maeda S, Nikolayevskyy V, Rasmussen M, Rastogi N, Samper S, Sanchez-Padilla E, Savic B, Chola Shamputa I, Shen A, Sng LH, Stakenas P, Toit T, Varaine F, Vukovic D, Wahl C, Warren R, Supply P, Niemann S & Wirth T (2015). Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nature Genetics 47: 242-249. IF = 41,31.