Introduction à la modélisation en écologie

L'objectif de ce cours est d'introduire les modèles linéaires généralisés en partant des modèles linéaires. Différents types de variables réponses très souvent rencontrées en écologie seront considérées : des variables à distributions normales, binomiales et de poisson permettant donc de décrire une partie des variables observées en écologie. Le choix du modèle sera basé sur une analyse exploratoire des données (analyse multivariée…). Les notions de sélection de variables pour expliquer la variable d'intérêt seront également considérées. Le cours alterne concepts théoriques et de nombreux exemples. La mise en pratique des différents modèles est réalisée avec le logiciel R. Le cours commencera par une mise en situation avec la collecte de données réelles afin de répondre à une question biologique. Ces données seront analysées par les étudiants à la fin de la semaine avec les outils qu'ils ont acquis.

Modalités d'enseignement :

- Mise en situation avec réalisation d'un protocole expérimental, collecte des données sur le terrain, et élaboration d'une base de données et analyse de ces données - cours /TD illustrés par de nombreux exemples issus de l'écologie Intervenants EPHE-PSL: Sarah Cubaynes (Co-responsable), Stéphanie Manel Pour les étudiants anglophones : des supports d'enseignement seront en anglais. + tutorat (4h) + un devoir à rendre en anglais.