En 2018-2019, l'offre de formation du Master BSE porte uniquement sur le M2.

En 2019-2020, les spécialités SSIB et BGE disparaîtront avec la fin de l’habilitation du Master BSE, mais elles seront remplacées par les parcours PPI et B&E du nouveau master SDV.

Le Master BSE comporte deux spécialités : Biodiversité et Gestion de l'Environnement (BGE) et Signalisation et Systèmes intégrés en Biologie (SSIB).

Le Master BSE a pour base la formation sur le terrain ou au laboratoire.