Avis de soutenance - doctorat - Daphné BAUDON | École Pratique des Hautes Études

Soutenue par Daphné BAUDON

Étude de la dynamique d'infection du moustique par le virus de la fièvre de la Vallée du Rift et impact des facteurs (a)biotiques sur la compétence vectorielle

Le virus de la fièvre de la vallée du Rift (RVFV) est un pathogène humain et animal endémique à l'Afrique, touchant également Madagascar, Mayotte et la péninsule arabique. Le RVFV est transmis par de nombreux moustiques vecteurs, principalement des genres Culex et Aedes. Son potentiel épidémiologique dépend de nombreux paramètres liés au virus, à l'hôte, au vecteur et à leurs interactions, sous l'influence de l'environnement. Parmi ces paramètres, la compétence vectorielle joue un rôle clé dans l'émergence et la propagation de la maladie mais elle reste encore insuffisamment caractérisée pour le RVFV. L'objectif de cette thèse est d'étudier la compétence vectorielle des moustiques pour le RVFV sous l'effet de différents paramètres liés à l'hôte, au moustique et au virus. Un jeu de données de référence de la dynamique de transmission du RVFV par deux espèces de moustiques (Aedes aegypti et Culex quinquefasciatus) a d'abord été établit montrant l'importance de l'origine cellulaire du RVFV, de la dose virale dans le repas de sang infectieux et du genre du moustique sur la compétence vectorielle. Ces résultats soulignent certaines différences clefs entre RVFV et d'autres arbovirus, mais aussi l'importance de considérer la dynamique d'infection virale dans le vecteur. Ensuite, la compétence vectorielle de deux souches de RVFV issues d'une épidémie en Mauritanie et montrant un profil de virulence distinct pour l'hôte (MRU2687-3 et MRU25010-30) a été étudiée. Grâce aux outils de génétique inverse, nous avons révélé l'importance de mutations virales dans la capacité du RVFV à infecter différentiellement Aedes aegypti et Culex quinquefasciatus. Ces travaux soulignent plus largement le rôle clef des déterminants génétiques arboviraux dans l'infection des hôtes et des vecteurs, et leur impact sur la circulation du virus et in fine la diffusion de la maladie. Ces données vont aussi permettre l'amélioration des modèles épidémiologiques et des stratégies de surveillance et de prévention des épidémies de fièvre de la vallée du Rift.

Mosquito infection dynamics of Rift Valley fever virus and the impact of biotic and abiotic factors on vector competence

Rift Valley fever virus (RVFV) is a human and animal pathogen endemic to Africa, also affecting Madagascar, Mayotte, and the Arabian Peninsula. RVFV is transmitted by wide range of mosquito vectors, mainly from the genera Culex and Aedes. Its epidemiological potential depends on many parameters related to the virus, the host, the vector, and their interactions, under environmental influence. Among these parameters, vector competence plays a key role in the emergence and spread of the disease, but it remains insufficiently characterized for RVFV. The objective of this thesis is to study mosquito vector competence for RVFV under the effect of different parameters related to the host, the mosquito, and the virus. A reference dataset describing the transmission dynamics of RVFV by two mosquito species (Aedes aegypti and Culex quinquefasciatus) was first established, showing the importance of the cellular origin of RVFV, the viral dose in the infectious blood meal, and the mosquito genus on vector competence. These results highlight key differences between RVFV and other arboviruses, as well as the importance of considering viral infection dynamics within the vector. Next, the vector competence of two RVFV strains originating from an outbreak in Mauritania and showing distinct virulence profiles in the host (MRU2687-3 and MRU25010-30) was investigated. Using reverse genetics tools, we revealed the importance of viral mutations in the ability of RVFV to differentially infect Aedes aegypti and Culex quinquefasciatus. More broadly, this work highlights the key role of arboviral genetic determinants in host and vector infection, and their impact on virus circulation and ultimately disease spread. These data will also contribute to improving epidemiological models as well as surveillance and prevention strategies for Rift Valley fever outbreaks.

Directeur de thèse :

Frédérick ARNAUD

Unité de recherche :

Infections virales et pathologie comparée (IVPC) - UMR 754

Membres du jury :

Directeur de thèse : Frédérick ARNAUD , Directeur de recherche (INRAE)
Rapporteur : Emilie PONDEVILLE , Senior Research Fellow (University of Glasgow)
Rapporteur : Christophe PAUPY , Directeur de recherche (Institut de recherche pour le développement (IRD))
CoDirecteur de thèse : Vincent RAQUIN , Maître de conférences (EPHE-PSL)
Examinateur : Sara MOUTAILLER , Directeur de recherche (ANSES)
Examinateur : Mathieu MATEO , Chargé de recherche (Institut Pasteur)
Examinateur : Catherine PAUL , Professeur (EPHE-PSL)

Diplôme :

Doctorat Systèmes intégrés, environnement et biodiversité

Spécialité de soutenance :

Microbiologie